陈木新1,2，陈家旭2，柳伟2，冯欣宇2，陈绅波1,2，陈韶红2，蔡玉春1,2，徐斌2，胡薇1,2*
CHEN Mu-xin1,2, CHEN Jia-xu2, LIU Wei2, FENG Xin-yu2, CHEN Shen-bo1,2,CHEN Shao-hong2, CAI Yu-chun1,2, XU Bin2, HU Wei1,2*
摘要：
目的 分析我国云南中缅边境等地5种疟原虫18S rDNA的基因差异和种系发育。 方法 2000-2015年收集来自我国云南中缅边境等地的疟疾患者血样（或疟原虫DNA），提取血样中的疟原虫DNA，对它们的18S rDNA基因进行扩增、测序分析，并与GenBank中疟原虫相应序列进行比较分析，利用邻接法（neighbor joining, NJ）、最大似然法（maximum likelihood, ML）和最大简约法（maximum parsimony, MP）构建系统进化树。 结果 共收集了94例疟疾患者血样或DNA，所有样品均扩增出18S rDNA基因序列。序列比对分析显示，恶性疟原虫（Plasmodium falciparum）、间日疟原虫（P. vivax）、三日疟原虫（P. malariae）、卵形疟原虫（P. ovale）和诺氏疟原虫（P. knowlesi）的种内差异分别为0～0.2%、0～0.1%、0～0.1%、0～0.1%和0。种系发育关系分析显示，NJ、MP和ML法构建的系统进化树的拓扑结构基本一致。本研究的疟原虫形成5个大的分支：恶性疟原虫形成一个分支，与GenBank中来自喀麦隆（KC428741、KC428742）、巴西（KC906718）和马来西亚（HQ283221）的分离株聚集在一起；间日疟原虫形成一个分支，其中大部分样品与来自喀麦隆（HF945443）、印度（HM014361、JQ627158）和哥伦比亚（U83877）的分离株形成一较小分支，小部分样本（Pv11、Pv18和Pv21）形成一个更小的分支后与食蟹猴疟原虫（P. cynomolgi）（L07559）相聚形成一较小分支；三日疟原虫形成一个分支，来自云南的三日疟原虫Pm1、Pm3和Pm4聚在一个小分支内，并与来自日本的分离株（AB250682）相聚，再与来自海南的分离株Pm5相聚，显示出地区差异性；卵形疟原虫形成一个分支，与来自越南的分离株（EU935736、AF387038）聚在一起；诺氏疟原虫形成一个分支，与来自缅甸的分离株（GU816250、GU816246）聚在一起。 结论 我国云南中缅边境等地5种疟原虫18S rDNA基因均无明显种内差异；种系发育关系分析显示，NJ、MP和ML法构建的系统进化树的拓扑结构基本一致。
