基于磷酸丙糖异构酶基因序列的蓝氏贾第鞭毛虫分子系统发育的研究

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ›› 2000, Vol. 18 ›› Issue (3): 5-145.

基于磷酸丙糖异构酶基因序列的蓝氏贾第鞭毛虫分子系统发育的研究

李继红¹;卢思奇²;张亚平¹;王凤芸²;文建凡¹

中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化开放研究实验室!昆明650223 首都医科大学细胞生物学系寄生虫学教研室!北京100054

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2000-06-30 发布日期:2000-06-30

MOLECULAR PHYLOGENY OF GIARDIA LAMBLIA BASED ON TRIOSE PHOSPHATE ISOMERASE (tim) GENE SEQUENCE

LI Ji hong¹;LU Si qi ²;ZHANG Ya ping ¹;WANG Feng yun ²;WEN Jian fan ¹

1 Key Laboratory of Cellular and Molecular Evolution;Chinese Academy of Sciences;Kunming 650233 2 Department of Cell Biology;Capital University of Medical Science,Beijing 100054

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2000-06-30 Published:2000-06-30

摘要/Abstract

摘要： 　　[目的 ]探讨蓝氏贾第鞭毛虫种内系统发育及遗传多样性。 [方法 ]对不同来源虫株的磷酸丙糖异构酶(tim)基因进行 PCR扩增、序列测定后 ,用简约法和 NJ法构建分子系统树进行系统学分析。 [结果 ]在所测序列中共有 12 4个位点存在变异 (2 3% ) ,且大多数为发生在第三密码子的同义突变 ,两种构树方法所得两树的分枝结构相似 ,均将受试的 16株蓝氏贾第鞭毛虫分为明显的两组。 [结论 ]tim基因可作为研究蓝氏贾第鞭毛虫群体遗传结构一个有效的遗传标记

关键词: 蓝氏贾第鞭毛虫, 磷酸丙糖异构酶, 遗传标记, 系统学, 序列分析

Abstract: 　Objective] To investigate the intraspecies phylogeny and genetic diversity of G. lamblia . [Methods] Total genomic DNA was extracted and partial fragments of tim gene were amplified by PCR. All the nucleotide sequences were analyzed by means of phylogenetic analysis, which were constructed with pasimony and N J methods. [Results] A total of 124 variable sites (23% of the total sequences detected) were defined, most of which were found at the silent sites of codons. Two similar phylogenetic trees were constructed, subdividing 16 isolates into two groups. [Conclusion] The genetic diversity of G. lamblia appear to be little affected by both the host and geography, while natural selection might play an important role at the DNA molecular evolution level of tim gene. The tim gene may be considered to be a very useful genetic marker of the population genetic structure of G. lamblia .

Key words: Giardia lamblia, triose phosphates isomerase, sequence analysis, phylogeny, genetic marker.

李继红;卢思奇;张亚平;王凤芸;文建凡. 基于磷酸丙糖异构酶基因序列的蓝氏贾第鞭毛虫分子系统发育的研究[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2000, 18(3): 5-145.

LIJihong;LUSiqi;ZHANGYaping;WANGFengyun;WENJianfan. MOLECULAR PHYLOGENY OF GIARDIA LAMBLIA BASED ON TRIOSE PHOSPHATE ISOMERASE (tim) GENE SEQUENCE[J]. Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases, 2000, 18(3): 5-145.

[1]	彭晓雪, 王旭, 简金花, 沈玉娟. 我国人群蓝氏贾第鞭毛虫感染及食源性污染现状[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2025, 43(2): 274-281.
[2]	陈云虹, 谢贤良, 李燕榕, 陈宝建, 林耀莹, 余文武, 余海峰. 不同地域株东方次睾吸虫线粒体nad1基因序列分析及种系发育研究[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2024, 42(5): 668-671.
[3]	闵向阳, 冯萌, 赵旭鸿, 翁文浩, 李汉华. 1例蓝氏贾第鞭毛虫感染的诊断[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2024, 42(2): 272-274.
[4]	王宁, 彭晗琪, 高常哲, 程羽珩, 吕大兵. “夜逸蚴”日本血吸虫线粒体基因组特征与系统进化的关系[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(6): 699-707.
[5]	高澜琳, 谢汉国, 林陈鑫, 江典伟, 蔡武卫, 郑丹. 基于COⅠ的褐云玛瑙螺广州管圆线虫系统进化分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(6): 756-759.
[6]	李奔福, 王正青, 徐倩, 字金荣, 严信留, 彭佳, 李建雄, 蔡璇, 吴方伟, 杨亚明. 云南省细粒棘球绦虫线粒体co1和nd1基因序列分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(3): 306-311.
[7]	王丹, 贺志权, 刘颖, 刘灵芝, 陈慧慧, 蒋甜甜, 纪鹏慧, 钱丹, 杨成运, 张红卫. 1例蓝氏贾第鞭毛虫感染者的虫种分子鉴定及基因溯源[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(3): 380-383.
[8]	刘雅芳, 陈彬, 芦新焱, 李光华, 杜春红, 姜丹丹, 杨兴. 云南微小扇头蜱线粒体基因组全序列测定与分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(5): 677-681.
[9]	朱名超, 朱娅. HIV合并人芽囊原虫和蓝氏贾第鞭毛虫感染1例[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(3): 315-318.
[10]	李淑凝, 李汶霖, 沈海娥, 王洋, 田喜凤. 蓝氏贾第鞭毛虫滋养体体外诱导中性粒细胞胞外诱捕网的形成[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(4): 455-460.
[11]	黎敏, 骆清清, 房辉, 曹晓琴. 花椒乙醇提取物体外抗蓝氏贾第鞭毛虫的作用[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(3): 359-364.
[12]	于铭川, 杨忠委, 王华然, 师丹阳, 周树青, 尹静, 孙树民. 基于LAMP微流控芯片检测蓝氏贾第鞭毛虫方法的建立[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(3): 402-405.
[13]	赵正虎, 钱胜南, 万静宜, 唐子茹, 沈双. 刚地弓形虫磷酸丙糖异构酶多克隆抗体的制备及鉴定分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(3): 311-316.
[14]	袁义雪, 郑国侠, 王丹丹, 专行, 杜萌, 王云华. 蓝氏贾第鞭毛虫核苷二磷酸激酶基因的克隆与表达[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(2): 190-193.
[15]	周成艳, 马君, 刘伟, 徐前明, 朱兴全. 印度华首线虫核糖体和线粒体基因序列多态性分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(1): 81-86.