王楠1, 滕飞翔1, 俞黎黎1, 杨李1, 张承伯1, 周鹰1,2, 崔玉宝1,2*
WANG Nan1, TENG Fei-xiang1, YU Li-li1, YANG Li1, ZHANG Cheng-bo1, ZHOU Ying1,2, CUI Yu-bao1,2*
摘要:
目的 获得粉尘螨(Dermatophagoides farinae)变应原Der f 8全长基因并构建其原核表达质粒。 方法 参考GenBank登录号为AY283295的Der f 8部分序列设计并合成引物。以粉尘螨总RNA为模板, RT-PCR扩增获得Der f 8部分片段。采用5′ cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends, RACE)获得Der f 8全长序列, 连接至pMD19-T载体, 热转化至大肠埃希菌(Escherichia coli), 挑取阳性菌落, 抽提质粒后测序。根据Der f 8全长序列设计并合成引物, 以粉尘螨总RNA为模板进行RT-PCR扩增, 产物回收后连接pCold TF载体, 热转化至E. coli, 涂板过夜培养后, 挑取阳性菌落, 抽提质粒后测序。将pCold TF-Der f 8质粒转化至E. coli BL21, 异丙基-β-D-硫代半乳糖苷诱导表达, 采用十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析表达产物。采用生物信息学软件预测Der f 8的理化特性、结构和功能, 并构建系统进化树。 结果 以Der f 8部分序列设计的引物行RT-PCR扩增获得Der f 8部分片段, 长度为600 bp; 5′ RACE获得Der f 8剩余序列, 长度为300 bp; 以全长基因序列设计的引物进行RT-PCR扩增获得了Der f 8基因CDS区, 长度为696 bp, 测序均正确。SDS-PAGE结果显示, 目的蛋白为可溶性表达, 相对分子质量(Mr)为81 000, 与预期大小一致。序列经生物信息学分析结果显示, Der f 8全长序列与参考序列(GenBank登录号为AY283295)同源性为98.49%, 预测其编码的疏水性蛋白具有谷胱甘肽S转移酶活性, 二级结构包括α-螺旋(45.45%)、延伸主链(11.26%)和无规卷曲(43.29%)。系统进化树结果显示, 粉尘螨与户尘螨(Dermatophagoides pteronyssinus)聚成一簇。 结论 获得了Der f 8全长基因及其原核表达质粒。