细粒棘球绦虫EgA31重组蛋白的抗原表位分析预测

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ›› 2012, Vol. 30 ›› Issue (1): 19-78-80.

细粒棘球绦虫EgA31重组蛋白的抗原表位分析预测

李玉娇1，杨晶2，赵慧1，贾海英3，张丽娜4，刘晓霞4，马秀敏4，温浩1，丁剑冰1，4 *

1 新疆医科大学第一附属医院新疆重点实验室，乌鲁木齐 830011；2新疆医科大学第一附属医院骨科，乌鲁木齐 830011；3新疆自治区人民医院，乌鲁木齐 830000；4 新疆医科大学基础医学院，乌鲁木齐 830011

出版日期:2012-02-29 发布日期:2012-09-28

Bioinformatics Prediction of EgA31 Recombinant Antigen Epitopes of Echinococcus granulosus

LI Yu-jiao1，YANG Jing2，ZHAO Hui1，JIA Hai-ying3，ZHANG Li-na4，LIU Xiao-xia4，MA Xiu-min4，WEN Hao1，DING Jian-bing1，4 *

1 Medical Research Center and Xinjiang Key Lab，the First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University，Urumqi 830011，China；2 Department of Orthopedics，the First Affiliated Hospital of Xinjiang Medical University，Urumqi 830011，China；3 The People′s Hospital of Xinjiang，Urumqi 830000，China；4 School of Basic Medicine，Xinjiang Medical University，Urumqi 830011，China

Online:2012-02-29 Published:2012-09-28

摘要/Abstract

摘要： 根据GenBank中细粒棘球绦虫EgA31序列（GenBank登录号为AF067807）设计引物，以细粒棘球绦虫mRNA为模板，RT-PCR扩增EgA31基因，将其克隆入pUCm-T载体，转化大肠埃希菌（E. coli）DH5α，筛选阳性克隆，经BamHⅠ、SacⅠ双酶切和PCR鉴定，获得阳性重组质粒pUCm-T/EgA31，并将测序正确的片段连接表达载体，成功构建重组质粒pET30a-EgA31。经序列分析和同源性比较，以及对其编码产物进行B细胞和T细胞表位分析，结果表明PCR扩增的特异条带为636 bp，与预期相符，与GenBank已知基因序列同源性为100%。编码产物B细胞和T细胞联合表位预测，氨基酸区域可能在32~79、79~95、105~124和141~154位。

关键词: 细粒棘球绦虫, pET30a-EgA31, 抗原表位, 生物信息学

Abstract: Specific primers were designed and synthesized based on the reported EgA31 gene of Echinococcus granulosus （GenBank Accession No. AF067807）. Total RNA was extracted from E. granulosus and its EgA31 gene was amplified by reverse transcription-polymerase chain raction （RT-PCR）. The PCR product was purified and cloned into plasmid pUCM-T，then transformed into Escherichia coli DH5α. The recombinant plasmids were screened and identified by digestion with restriction enzyme and PCR amplification. The positive recombinant plasmid pUCM-T/EgA31 was confirmed by sequencing and homology comparison. Five parameters and methods were used to predict B-cell epitopes in amino acid sequence of EgA31. The amplified DNA fragment （636 bp） had an identity of 100% with the EgA31 gene sequence of E. granulosus. B-cell and T-cell epitopes of EgA31 were probably at or adjacent to 32-79，79-95，105-124 and 141-154 in its amino acid sequence.

Key words: Echinococcus granulosus, pET30a-EgA31, Antigenic epitope, Bioinformatics

李玉娇1，杨晶2，赵慧1，贾海英3，张丽娜4，刘晓霞4，马秀敏4，温浩1，丁剑冰1，4 *. 细粒棘球绦虫EgA31重组蛋白的抗原表位分析预测[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2012, 30(1): 19-78-80.

LI Yu-jiao1，YANG Jing2，ZHAO Hui1，JIA Hai-ying3，ZHANG Li-na4，LIU Xiao-xia4，MA Xiu-min4，WEN Hao1，DING Jian-bing1，4 *. Bioinformatics Prediction of EgA31 Recombinant Antigen Epitopes of Echinococcus granulosus[J]. Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases, 2012, 30(1): 19-78-80.

[1]	吴晓莹, 胡媛, 曹建平. 细粒棘球绦虫多肽-壳聚糖季铵盐纳米颗粒的制备[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(3): 300-305.
[2]	李奔福, 王正青, 徐倩, 字金荣, 严信留, 彭佳, 李建雄, 蔡璇, 吴方伟, 杨亚明. 云南省细粒棘球绦虫线粒体co1和nd1基因序列分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(3): 306-311.
[3]	焦红杰, 齐文静, 郭刚, 包建玲, 吴川川, 宋传龙, 李军, 张文宝, 严媚. 细粒棘球蚴抗原B对小鼠巨噬细胞RAW264.7的极化作用[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(1): 23-28.
[4]	李润花, 殷国荣. 刚地弓形虫病多表位疫苗的研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(5): 661-667.
[5]	仲顺虎, 孙玥, 郭小腊, 郑亚东, 陈轶霞. 多房棘球蚴感染小鼠脾淋巴细胞中差异表达miRNA的鉴定及其生物信息学分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(3): 288-294.
[6]	孙叶挺, 江楠, 姜岩岩, 李腾, 蒋小凤, 曹建平, 沈玉娟. 细粒棘球蚴原头节源外泌体体外刺激髓源抑制性细胞极化的研究[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(2): 175-180.
[7]	苏雅静, 乔霞, 汪澎涛, 康宇婷, 杨宁爱, 贾伟, 赵志军. 弓形虫毒力相关效应分子ROP16Ⅲ诱导人肺腺癌A549细胞的基因表达谱[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(4): 473-480.
[8]	田梦潇, 臧小燕, 郭刚, 齐文静, 郭宝平, 任远, 李军, 张文宝. 丝氨酸蛋白酶在细粒棘球绦虫中的表达及活性鉴定[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(2): 233-239.
[9]	何成, 潘帅, 许妹珍, 原飞, 何静妹, 刘转转. 刚地弓形虫蛋白磷酸酶的全蛋白质组鉴定及生物信息学分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(1): 120-124.
[10]	范俊杰, 韩秀敏, Nur Fazleen Binti Idris, 李锴, 谭青青, 曹纹侨, 李想, 廖鹏, 叶彬. 细粒棘球绦虫蛋白激酶A的生物信息学特征及免疫反应性[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(6): 682-687.
[11]	郭楚桐, 欧阳春艳, 何俊贤, 季树宇, 杨礼腾, 刘晓宇. 屋尘螨第十类变应原的克隆、表达、纯化及免疫原性分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(6): 723-729.
[12]	曹胜魁, 张小凡, 魏玉环, 潘佳明, 曹建平, 沈玉娟, 陈家旭. 细粒棘球蚴感染小鼠肝精氨酸酶的表达和功能研究[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(3): 304-309.
[13]	周鸿让, 茅光耀, 王晓玲, 陈木新, 余晴, 王莹, 艾琳, 肖宁. 重组酶介导的多重核酸等温扩增法鉴别细粒棘球绦虫和多房棘球绦虫技术的建立与应用[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(3): 310-316.
[14]	郑文琪, 冯学敏, 曹雅明, 韩艳秋, 王俊瑞. 伯氏疟原虫静息巯基氧化酶的生物信息学分析和体外酶活检测[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(2): 159-165.
[15]	宋宏宇, 梁雨晴, 华瑞其, 史媛, 阳爱国, 郭莉, 袁东波, 谢跃, 杨光友. 细粒棘球绦虫磷酸甘油酸变位酶的表达、定位和诊断价值的初步评价[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(2): 194-201.