欧猬迭宫绦虫全长cDNA文库构建及鉴定

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ›› 2010, Vol. 28 ›› Issue (5): 18-394.

欧猬迭宫绦虫全长cDNA文库构建及鉴定

吕刚^*，芦亚君，范志刚，史大中，甘秀凤，钟赛凤

海南医学院寄生虫学教研室，海口 571101

收稿日期:1900-01-01 修回日期:1900-01-01 出版日期:2010-10-30 发布日期:2010-11-09
通讯作者: 吕刚

Construction and identification of a full-length cDNA library from Spirometra erinaceieuropaei

LV Gang^*，LU Ya-jun，FAN Zhi-gang，SHI Da-zhong，GAN Xiu-feng，ZHONG Sai-feng

Department of Parasitology，Hainan Medical College，Haikou 571101，China

Received:1900-01-01 Revised:1900-01-01 Online:2010-10-30 Published:2010-11-09
Contact: LV Gang

摘要/Abstract

摘要： 应用SMART方法成功构建欧猬迭宫绦虫成虫全长cDNA文库，文库的重组率为95.5%，库容量为1.06×106；平均插入片段长度约为1.4 kb。选取48个随机阳性克隆测序，去除＜450 bp序列后获得36个有效表达序列标签（EST），平均长度为674 bp，其中单基因簇（unigene）比例为58.3％（21/36）；26条具有同源性序列的EST中15条有或可能有5′末端，全长性比率为57.7％（15/26）。文库质量良好，可用于大规模EST测序。

关键词: 欧猬迭宫绦虫, 成虫, 全长cDNA文库

Abstract: The full-length pBluescript Ⅱ SK cDNA library of adult Spirometra erinaceieuropaei was constructed by using the SMART method. Data showed that 95.5% of the library was recombinant and the titer of the library was 1.06×106. The average insert size of the library was about 1.4 kb. Forty-eight randomly selected clones were sequenced. A set of 36 effective expressed sequence tags （ESTs） with the average size of 674 bp was obtained after excluding clones shorter than 450 bp. The unigenes occupied 58.3% of the 36 ESTs. The rate of full-length cDNAs were 57.7% （15/26）. The high-quality of full-length cDNA library could be used for large scale EST sequencing.

Key words: Spirometra erinaceieuropaei, Adult, Full-length cDNA Library

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