中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ›› 2012, Vol. 30 ›› Issue (4): 4-268-273.
李石柱1,张丽1,刘琴1,吕山1,王强1,钱颖骏1,杨坤2,周晓农1 *
LI Shi-zhu1,ZHANG Li1,LIU Qin1,LV Shan1,WANG Qiang1,QIAN Ying-jun1,YANG Kun2,ZHOU Xiao-nong1*
摘要: 目的 应用微卫星DNA分子标志分析中国长江中下游地区湖北钉螺群体的遗传结构。 方法 利用6对微卫星DNA引物,对采集自湖沼型血吸虫病流行区的湖南汉寿县、湖北阳新县、江西星子县、安徽当涂县和江苏扬州邗江区的湖北钉螺的P84、T5-13、T5-11、T4-22、T6-27和P82等6个位点进行荧光标记通用引物PCR扩增。每个采集点采集20~50个钉螺标本,共165个。统计分析各群体的等位基因数(Na)、近交系数(FIS)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、群体间的遗传分化系数(FST)和遗传距离,根据遗传距离进行聚类分析,并进行分子变异方差分析(AMOVA)。 结果 5个湖北钉螺群体在6个微卫星位点等位基因数范围为3~33,平均为15.833。群体的平均He和Ho范围分别为0.600~0.883和0.308~0.759,两者在湖北群体最高,在江苏群体最低。群体的FIS范围为0.143~0.539。成对群体间的FST范围为0.0006~0.0531,由于FST值较小,提示群体间未出现明显遗传分化。各群体的平均PIC为0.511~0.850,除江苏群体外,均为高度多态。分级AMOVA结算结果显示,变异主要存在于个体间,占总变异的95.2%。聚类分析结果显示,安徽群体与江苏群体首先聚为一支,然后依次同湖南、江西、湖北群体聚在一起。 结论 湖北钉螺多样性较为丰富;聚类分析结果符合湖北钉螺的地理分布格局;5个群体之间遗传差异较小,微卫星DNA的变异主要存在个体间。