恶性疟原虫PFC0460w基因片段的克隆与生物信息学分析

中国寄生虫学与寄生虫病杂志 ›› 2012, Vol. 30 ›› Issue (1): 18-76-77.

恶性疟原虫PFC0460w基因片段的克隆与生物信息学分析

周洪昌*，戴佳丽，樊宬诚，钟慧雅，沈雨晴

湖州师范学院医学院创新实验室，湖州 313000

出版日期:2012-02-29 发布日期:2012-09-28

Cloning and Bioinformatics Analysis of PFC0460w in Plasmodium falciparum

ZHOU Hong-chang*，DAI Jia-li，FAN Cheng-cheng，ZHONG Hui-ya，SHEN Yu-qing

Innovation Laboratory，Medical School of Huzhou Teachers College，Huzhou 313000，China

Online:2012-02-29 Published:2012-09-28

摘要/Abstract

摘要： 用逆转录PCR方法从恶性疟原虫3D7株红内期RNA扩增PFC0460w基因片段，克隆于pGEM-T easy载体，转化大肠埃希菌DH5α，筛选阳性克隆，PCR鉴定、测序并作序列分析。结果显示，从恶性疟原虫3D7株中扩增到3种PFC0460w片段序列，分别为618、597和543 bp，其中618 bp的片段序列与PlasmoDB数据库中的已知序列完全一致（GenBank登录号为XM_001351147）。597 bp和543 bp片段序列已登录GenBank数据库，登录号分别为JF799872和JF799873。618 bp片段编码205个氨基酸，经Robbeta服务器结构预测，其编码的蛋白质可能有5种三维结构。

关键词: 恶性疟原虫, 基因克隆, PFC0460w

Abstract: The gene fragment of PFC0460w was amplified from RNA of Plasmodium falciparum 3D7 strain with RT-PCR，and cloned into pGEM-T easy vector. The recombinant plasmid was transformed into E. coli DH5α and the positive clones were selected，which were identified by PCR and sequencing. The results showed that there were three sequences of PFC0460w fragment, respectively with length of 618，597 and 543 bp. The 618 bp fragment was completely consistent with the sequence published in PlasmoDB（GenBank No. XM_001351147），and the 597 bp and 543 bp fragments were submitted to GenBank with Accession No. of JF799872 and JF799873，respectively. 205 amino acids were encoded by the 618 bp fragment，and five kinds of protein structure were predicted by Robetta.

Key words: Plasmodium falciparum, Gene clone, PFC0460w

周洪昌*，戴佳丽，樊宬诚，钟慧雅，沈雨晴. 恶性疟原虫PFC0460w基因片段的克隆与生物信息学分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2012, 30(1): 18-76-77.

ZHOU Hong-chang*，DAI Jia-li，FAN Cheng-cheng，ZHONG Hui-ya，SHEN Yu-qing. Cloning and Bioinformatics Analysis of PFC0460w in Plasmodium falciparum[J]. Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases, 2012, 30(1): 18-76-77.

[1]	周瑞敏, 纪鹏慧, 李素华, 杨成运, 刘颖, 钱丹, 邓艳, 鲁德领, 赵玉玲, 赵东阳, 张红卫. 河南省自赤道几内亚输入的恶性疟原虫抗药性基因多态性分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(5): 593-600.
[2]	徐少杰, 陈绅波, 陈军虎. 恶性疟原虫重复散布家族基因转录调控的研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2023, 41(3): 374-379.
[3]	田斌, 廖瑜, 文岚, 肖芳, 张兵, 申晓君. 长沙市122例输入性恶性疟原虫多药抗性基因1拷贝数变异分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2022, 40(1): 127-131.
[4]	石明丽, 肖波, 江陆斌. 恶性疟原虫var基因的表达调控机制研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(6): 719-724.
[5]	史善美, 陈军虎. 恶性疟原虫RIFIN蛋白的结构和功能研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2021, 39(2): 249-255.
[6]	张苍林, 聂仁华, 徐丹, 吕高伟, 王剑, 杨亚明, 邓艳, 刘言, 周红宁. 中缅边境地区恶性疟原虫Pfcrt、Pfmdr和PfK13基因多态性与体外药物敏感性相关性的分析[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(5): 580-588.
[7]	叶升玉, 成依依, 李曼, 周红宁. 我国恶性疟原虫主要药物抗性研究[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(5): 631-636.
[8]	周水茂, 涂祖武, 杨燕, 陈芳, 贾西帅. 环介导等温扩增检测恶性疟原虫与其他疟原虫的效果评价[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(4): 423-428.
[9]	叶升玉, 成依依, 李曼, 周红宁. 恶性疟原虫抗药性分子标记检测方法研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2020, 38(4): 490-495.
[10]	李仁清, 王小梅, 孙玉兰, 吕燕宁, 窦相峰, 王全意. 宏基因组学二代测序技术在输入性疟疾诊断中的应用[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(6): 727-729.
[11]	李润花, 关丽, 殷国荣. 刚地弓形虫滑行相关蛋白45的克隆、表达与免疫反应性检测[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2019, 37(5): 563-567.
[12]	牟畇珊, 李璐杰, 吴银娟, 李学荣. 疟原虫青蒿素耐药分子机制探索[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2018, 36(6): 636-642.
[13]	刘纯, NdoumadiambaALFRED, MounzieGouGNONDA. 胶体金恶性疟原虫检测试剂盒在非洲加蓬的临床应用[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2018, 36(6): 679-680.
[14]	毛强, 裴福全, 岑咏珍, 刘梦然, 张豪, 邓卓晖. 广东省1例输血性恶性疟病例的实验室检测和溯源调查[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2018, 36(5): 529-533.
[15]	王志华, 魏春燕, 王恒. 恶性疟原虫非编码RNA的研究进展[J]. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志, 2018, 36(4): 409-413.